El 20 de diciembre del 2004, se firmó el convenio de Cooperación educativa entre la Universidad Alas Peruanas y el Instituto Superior Tecnológico Privado San Agustín, el cual ha sido renovado por cino años más, el 12 de Octubre del 2009. Dicho convenio tiene por finalidad crear y desarrollar los mecanismos e instrumentos de mutua colaboración y beneficio que permitan la realización de proyectos de formación, capacitación y especialización profesional, así como el desarrollo de la investigación científica de proyección social y extensión institucional, a fin de desarrollar actividades que de manera enunciativa y no limitativa se mencionan a continuación:

• Hacer posible el ingreso de los titulados y/o egresados de EL INSTITUTO, a las diferentes Facultades y Escuelas Profesionales de LA UNIVERSIDAD.
• Convalidar los cursos en base a la correspondencia silábica de los planes de estudios de las carreras profesionales de ambas instituciones.
• Continuar la formación profesional de los alumnos de EL INSTITUTO, como alumnos regulares de LA UNIVERSIDAD hasta optar el grado académico de bachiller, título profesional y continuar estudios de post grado.
• Brindarse mutuamente el intercambio de tecnología, infraestructura, personal docente y otros elementos que sean necesarios para el mejor desarrollo de las actividades que se desarrollen en el marco del presente convenio.
• Los postulantes de EL INSTITUTO, personal docente, administrativo y sus familiares directos (cónyuge e hijos), tendrán un tratamiento especial en la escala de pensiones considerándolos en la Categoría “H”, de conformidad con las normas establecidas por la Oficina de Bienestar Universitario.